RIPA 레시피- Cell Lysis Buffer

RIPA 레시피- Cell Lysis Buffer

프로토콜 및 도움말

RIPA Buffer 레시피 – Cell Lysis(세포 용해) | Assay Genie

RIPA(Radio Immuno Precipitation Assay) buffer는 western blot 또는 immunoprecipitation(면역 침강 검사)를 수행할 때 주로 사용됩니다. RIPA buffer는 세포를 용해시키고 배양된 세포로부터 단백질을 추출하기 위해 사용됩니다. RIPA buffer cell lysis(세포 용해)를 통해 단백질 농도를 측정할 수 있습니다. RIPA buffer는 세 가지 비이온성 및 이온성 계면활성제를 함유하고 있기 때문에 이상적인 세포 용해 시약입니다.

단백질의 보존 : 단백질 상호작용

단백질-단백질 상호 작용을 보존하거나 변성을 줄여야 경우 SDS(이온성 계면활성제) 또는 Triton X-100(비이온성 계면활성제) 사용하지 않는 RIPA buffer 레시피를 사용하는 것이 좋습니다.

RIPA buffer 레시피

RIPA buffer – 레시피 A

1% v/v NP-40

20mM Tris-HCL pH 7.4

5mM Sodium Pyrophosphate

5mM EDTA

새로 첨가된 proteinase inhibitors (Leupeptin, PMSF, Sodium Ortovanadate)

RIPA buffer – 레시피 B

50mM Tris HCL pH 7.4

50 mM NaCl

2mM EDTA

0.1% SDS

새로 첨가된 proteinase inhibitors (Apoprotein, Leupeptin, DTT and PMSF)

RIPA Buffer를 이용한 세포용해액 제조

  1.  세포를 얼음처럼 차가운 PBS로 세척한다. 1,500 x G에서 마이크로 원심분리기에 세포를 5분간 회전시켜 cell media를 제거한다. 흡인하여 media를 제거한다. 셀을 차가운 PBS에 재현탁시킨 후, 1,500 X G에서 5분간 원심분리한다.
  2. PBS를 흡인한다.
  3. 차가운 RIPA Buffer (107 세포 당 약 1ml)를 첨가한다.
  4. 멸균된 피펫 팁을 사용하여 플레이트에서 adherent cell(부착세포)를 긁어낸다.
  5. 원심력 및 시간은 세포 유형에 따라 달라질 수 있다.
  6. 원심분리기에서 꺼내어 얼음 위에 보관한다.
  7. 상등액을 흡인하여 새 튜브에 넣고 얼음 위에 보관한 후 펠릿을 버린다.
  8. Bradford assay, a Lowry assay 또는 BCA(bicinchoninic acid)를 사용하여 단백질 농도를 측정하다. BSArk standard로 사용될 수 있다.
  9. 단백질 농도가 결정되면, 샘플을 -20 °C/-80 °C에서 냉동하거나 로딩 준비를 할 수 있다.

젤 로딩을 위한 샘플 준비

  1. 시료를 적정 농도로 normalise한다.
  2. 단백질을 변성시켜 Lameli buffer를 사용하여 항체를 검출할 수 있도록 한다.
  3. 95°C에서 5분간 heat block한다.
  4. Acrylamide gel에 샘플을 로딩한다.

Laemmli Buffer

Laemmli Buffer는 disulphide 결합을 감소시키는 역할을 하는 beta-2-mercaptoethanol을 함유하고 있으며, 이는 단백질을 변성시킵니다. 또한 Laemmli buffer에는 gel electrophoresis(젤 전기영동)을 위한 음전하를 제공하는 SDS 성분과, 샘플의 밀도를 높여주는 glycerol이 포함되어 있습니다.

성분 용량

Tris (1.0 M, pH 6.8)

10 mL

SDS

4.0 g

Glycerol

20 mL

β-Mercaptoethanol

10 mL

Bromophenol blue

0.1 g

ddH20

50mL로 맞춘다